华西医院泌尿外科是我国最早建立的泌尿专科之一，在泌尿外科领域拥有雄厚的基础，一直是我国泌尿外科常见、多发病临床医疗、教学、科研中心，也是泌尿系疑难危重疾病诊治中心，整体学术水平长期位居全国前列。华西医院泌尿外科连续4年位列中国医院科技量值排行榜第一，最新复旦大学中国最佳专科排行榜声誉排名全国第三，综合排名全国第二，科研排名全国第一。华西医院泌尿外科是美国外科医师协会（ACS）在亚洲地区首家认证的教育机构；是英国爱丁堡皇家外科学院和香港外科医学院认证的国际泌尿外科专科医师培训中心；同时也是国际泌尿外科协会（SIU）认证的培训中心。2012年，泌尿外科通过卫生部国家临床重点专科建设项目审批。
截至2022年，泌尿外科现有在职医师60人，护理62人。其中正高级职称17人，副高级职称19人；博士生导师15人、硕士生导师20人；国家“千人计划”专家1人，四川省“千人计划”专家1人。是国内唯一同时拥有医学会和医师协会副主委和副会长，并覆盖两大学（协）会各亚专业学组成员的学科。拥有专科专用的层流标准手术室6间，配备泌尿Davinci手术机器人四代Xi系统1台，另有安置了泌尿检查台的层流手术室1间，层流膀胱镜检查治疗室1间。科室拥有目前国内泌尿疾病最齐全、最具竞争力的亚专业设置，包括泌尿肿瘤、修复重建、前列腺疾病、男科、移植与透析、尿控、结石、微创等8个亚专业，开展泌尿外科所有手术治疗及系统化治疗。科室目前开放床位269张，总门诊量超过19万人次/年，平均出院病人超过10,000人/年，手术量约21,000例/年，对各种泌尿系统疑难重症已形成自己的特色和优势。
泌尿外科在全面均衡发展各亚专业的同时，还重点发展优势亚专病/亚专业。泌尿肿瘤亚专业团队在国内综合性医院中最早建立泌尿肿瘤MDT团队，是国内泌尿肿瘤MDT四大示范基地之一，同时率先在国内建立局限性前列腺癌队列；团队针对泌尿肿瘤地域特点，牵头成立国内肾上腺高血压联盟及少见肾癌协作组，高致死性泌尿肿瘤和罕见肿瘤的精准诊治和转化研究位居全国前列；专业组先后荣获中国泌尿外科领域最高奖“吴阶平泌尿外科医学奖”及“金膀胱镜奖”。修复重建与尿控亚专业团队在国内率先开展多项尿路修复重建的创新术式，显著提高复杂性尿道狭窄的治疗效果，并作为盟主单位牵头成立全国泌尿外科修复重建联盟，引领国内泌尿修复重建发展，再次荣获中国泌尿外科领域最高奖“吴阶平泌尿外科医学奖”；团队近年来开展了大量妇科泌尿疾病的诊疗工作，诊治水平处于国内领先水平，荣获国内相关领域最高奖“大禹奖”和“女娲奖”。肾移植亚专业团队针对肾源缺乏的现状，创新性开展多项肾移植技术革新，在活体肾移植、ABO血型不合肾移植以及排斥反应的防治等领域位居全国领先地位。自2006年开展亲体肾移植手术以来，已成为国内活体肾移植和总体肾移植数最大单中心，获全国肾移植专项奖“扁鹊奖”。男科亚专业团队一直致力于与国际一流大学长期深度合作，通过深度交流加速发展，极大地提升华西泌尿男科亚专业在全球和全国的影响力与竞争力。在国内最早全面开展几乎所有男科相关的微创外科手术，达到与国际接轨，与世界同步。结石亚专业团队是全球腔道泌尿外科协会在大中华地区的首个合作单位，结石微创技术具有国际领先水准。泌尿护理团队为全面推进医护一体化建设，国内率先建立了伤口护理和前列腺癌专病护理队伍，通过降低伤口感染率、强化肿瘤患者全程管理，进一步提升了患者就医体验和满意度。
2015年正式成立四川大学华西医院泌尿外科研究所，开展泌尿系统相关疾病的前沿基础和临床研究。研究所下辖4个研究室，分别是泌尿系肿瘤与前列腺疾病研究室、泌尿系组织修复与重建研究室、泌尿男科学研究室和肾移植研究室。研究所现有3名专职科研人员，4名技术人员，十余名在站专职博士后及数十名入室硕、博士研究生，并引进2名国家及省级“青千”人才和4名特聘外国专家。泌尿外科及泌尿外科研究所先后与MD Anderson、Mayo Clinic、Duke University、UCLA、Yale University、UC Davis和Liverpool University等国际著名医学中心/研究所建立了长期的临床科研合作，实现科研资源和学术成果的共享。截止2022年，单独或联合院内相关平台先后获得 9项国家科技重大专项和国家重点项目、1项国家自然科学基金创新群体项目以及70项国家自然科学基金项目；牵头多项多中心临床试验；并在包括CancerCell, Nature Communications, PNAS, European Urology, Signal Transduction andTargeted Therapy, Kidney International, J Immunother Cancer, Clinical CancerRes, Biomaterial, BMC Medicine等高水平专业领域国际期刊上发表高质量SCI论文超1000篇。
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