四川大学华西医院感染病学学科具有60多年的历史，是国家首批建立博、硕士点和博士后流动站的学科。1987年被批准为国家药品临床研究机构抗感染专业基地，1993年获卫生部临床重点学科建设项目，2003年经批准成为卫生部感染病专业住院医师培训基地，2004年被评为四川省重点学科,2013年获批国家临床重点专科（建设项目）。本学科是我国是我国西部地区感染性疾病的诊疗、研究中心，西部地区感染性疾病疑难重症的诊治中心，感染性疾病科学研究和专业人才培养的重要基地。中心现拥有病床150张，设有传染病房、感染病房及感染性疾病研究室。学科现已发展多个各具特色的亚专业，包括病毒性肝炎、人工肝、结核病、HIV/AIDS及机会性感染、疑难发热以及中枢神经系统感染等。
本学科经过多年来不断建设，逐步形成了以病毒性肝炎、感染与化疗为龙头，涵盖多种感染性疾病的研究特色。在病毒性肝炎特别是乙型肝炎发病机理及临床优化和生物治疗研究、病原菌耐药性分子机理研究、抗感染新药的临床研究方面处于国内领先水平。学科发挥感染疾病诊治领域的中心指导作用，在感染的病原学诊断、重症肝病诊治、各类突发传染病的现场抢救及工作指导、发热待诊、各类耐药菌感染、导管相关性感染、免疫功能低下者感染、肺外结核病、寄生虫感染及院内感染控制，AIDS抗病毒治疗以及机会性感染等方面具有丰富的经验，向整个西南地区提供了重要的技术支撑，发挥着重要的咨询及指导作用。
学科坚持 “以人为本、崇尚学术、追求卓越”之精神，遵循“厚德精业、求实创新”之院训，加强人才梯队建设，大力完善学科基础设施建设，学科下属感染性疾病研究室是生物治疗国家重点实验室的重要组成部分，同时也是四川省感染性疾病分子生物学重点实验室，致力于感染性疾病的基础与应用基础研究。拥有分子生物学、分子病理学、细胞生物学、免疫学和实验动物学研究工作的技术平台以及P2级生物安全实验操作技术平台，具有承担临床和基础研究重大科研项目的能力。在人才培养、承担科研项目、发表科研论著等方面，位于全国前列。目前学科拥有博士生导师5名，硕士生导师15名。学科带头人宗志勇教授目前担任中心主任，教育部长江特岗学者，国家自然科学基金优青获得者、四川大学华西医院病原微生物研究中心主任。英国皇家学会牛顿高级学者基金获得者，入选四川省学术技术带头人，担任亚太感控学会执行理事、国家卫健委医疗机构感染防控专家委员会副主任委员、国家卫生标准委员会医院感染控制标准专业委员会委员、中华预防医学会医院感染控制分会副主任委员等。
本学科已成功申请并承担了包括国家科技部“十二五”、“十一五”传染病重大专项、国家杰出青年基金、“863”高技术项目、“973”分课题、国家自然科学基金，国家自然基金优秀青年基金等课题在内的多项国家级和部省级科研课题，拥有科研经费2500余万。
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