药物化学是利用化学的概念和方法来发现、合成、确证和开发药物，对药物结构和活性进行研究，并从分子水平上研究药物在体内的作用方式和作用机理的一门学科。该学科是建立在化学和生物医学基础上的交叉学科。本专业依托于华西临床医学院和华西药学院，以新药创制为目的，进行各种新型先导化合物设计与合成，阐明其理化及生物学性质，研究相关分子在生物大分子水平、细胞水平、以及动物模型水平上的相互作用规律。
本专业重点围绕肿瘤的精准诊疗、神经系统疾病、重大精神疾病相关的小分子药物，分子影像药物，麻醉药物的设计和开发。
现共有导师4人（博士生导师3人，硕士导师1人），专业实验室总面积400余㎡，近五年承担国家自然科学基金等科研项目数项，共获科研经费600余万元。发表高水平科研论文50余篇，申请国内外发明专利20余项。
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