参与多项国家级和省部级科研项目,包括国家自然科学基金、卫生部临床学科重点建设项目、科技部重大专项-传染病专项、美国中华医学基金会项目、四川省科技厅项目和四川省卫生与计划生育委员会课题。主持的国家自然科学基金面上项目:调控Toll样受体信号通路的miRNAs内遗传变异与肺结核关联性及其分子机制研究(33万元),四川省科技厅-科技支撑计划:结核相关的特异性microRNA标志物筛选及结核早期分子诊断试剂盒研究(20万元),四川省科技厅-重点研发项目:基于多重信号放大技术和发光纳米材料的HIV超灵敏可视化诊断研究(20万元),四川省卫生与计划生育委员会课题:医疗机构HIV检测和感染人群特征研究(20万元)。主要参与的国家自然科学基金:Ghrelin抑制机械通气肺损伤炎症的内源性防御机制研究(20万元)和miRNA启动子区结合组蛋白H3赖氨酸4甲基化调控结核分枝杆菌诱导巨噬细胞凋亡的机制研究(23万元),卫生部-临床学科重点建设项目:西部多民族结核分枝杆菌快速检测技术及耐药分析平台的建立及推广应用 (200万元),科技重大专项-传染病专项:四川省绵阳市艾滋病、乙肝和结核病规模化现场流行病学干预及分级协同综合防治一体化示范研究 (2349.5万元),美国中华医学基金会项目:临床微生物学与感染性疾病(42万美元)、实验医学(40万美元)和实验室认可(82万美元)、四川省科技厅-科技支撑计划:利用蛋白质芯片技术筛查不同耐药结核的特异性蛋白标记物以及耐药结核早期分子诊断试剂盒研究(10万元)和利用高分辨率熔解曲线方法建立快速高通量的结核耐药相关基因突变检测试剂盒(20万元)等。获中华医学科学技术进步三等奖1项(挤压综合征临床救治技术及多学科协作应用)和四川省科学技术进步一等奖1项(临床医学检验方法性能评价与质量控制体系的建立及推广应用研究)。以第一作者和通讯作者发表论文120余篇,申请国家发明专利2项。参编教材和专著20余部。参编国家卫生行业标准和专家共识。